Перечень редких и находящихся под угрозой исчезновения виды в Чаинском районе Томской области
Животные:
| Кобчик – Erythropus vespertinus |
| Обыкновенный осоед – Pernis apivorus |
| Орлан-белохвост – Haliaeetus albicilla |
| Филин – Bubo bubo |
| Удод – Upupa epops |
| Овсянка-дубровник – Emberiza aureola |
| Серый журавль – Grus grus |
| Обыкновенный зимородок – Alcedo atthis |
| Гуменник – Anser fabalis |
| Красношейная поганка – Podiceps auritus |
| Малая крачка – Sterna albifrons |
| Иглохвостый стриж – Hirundapus caudacutus |
| Хрустан – Eudromias morinellus |
| Средний кроншнеп – Numenius phaeopus |
| Степной лунь – Circus macrourus |
| Лебедь-кликун – Cygnus cygnus |
| Большой кроншнеп – Numenius arquata |
| Двухцветный кожан – Vespertilio murinus |
Растения:
| Плагиомний густозубчатый – Plagiomnium confertidens |
| Неккера перистая – Neckera pennata |
| Воронец колосистый – Actaea spicata |
| Липа сердцелистная – Tilia cordata |
| Рогульник или водяной орех плавающий – Trapa natans |
| Гроздовник многораздельный – Botrychium multifidum |
| Кубышка малая – Nuphar pumila |
| Гнездовка настоящая – Neottia nidus-avis |
| Зверобой большой – Hypericum ascyron |
| Корневищник судетский – Rhizomatopteris sudetica |
Грибы:
| Лобария легочная – Lobaria pulmonaria |