Перечень редких и находящихся под угрозой исчезновения виды в Молчановском районе Томской области
Животные:
| Шмель модестус или скромный – Bombus modestus |
| Шмель моховой – Bombus muscorum |
| Шмель патагиатус или окаймленный – Bombus patagiatus |
| Желтушка торфяниковая – Colias palaeno |
| Обыкновенный уж – Natrix natrix |
| Обыкновенный тритон – Lissotriton vulgaris |
| Черный аист – Ciconia nigra |
| Филин – Bubo bubo |
| Большая поганка или Чомга – Podiceps cristatus |
| Орлан-белохвост – Haliaeetus albicilla |
| Обыкновенный серый сорокопут – Lanius excubitor excubitor |
| Красношейная поганка – Podiceps auritus |
| Кулик-сорока (материковый) – Haematopus ostralegus longipes |
| Большой веретенник – Limosa limosa |
| Большой подорлик – Aquila clanga |
| Дербник – Falco columbarius |
| Обыкновенный осоед – Pernis apivorus |
| Беркут – Aquila chrysaetos |
| Иглохвостый стриж – Hirundapus caudacutus |
| Савка – Oxyura leucocephala |
| Белая или полярная сова – Nyctea scandiaca |
| Малая крачка – Sterna albifrons |
| Обыкновенный зимородок – Alcedo atthis |
| Большой кроншнеп – Numenius arquata |
| Гуменник – Anser fabalis |
| Бородатая неясыть – Strix nebulosa |
| Лебедь-кликун – Cygnus cygnus |
| Скопа – Pandion haliaetus |
| Овсянка-дубровник – Emberiza aureola |
| Овсянка-ремез – Emberiza rustica |
| Кобчик – Erythropus vespertinus |
| Краснозобая казарка – Rufibrenta ruficollis |
| Сибирская косуля – Capreolus pygargus |
Растения:
| Дремлик зимовниковый – Epipactis helleborine |
| Гроздовник многораздельный – Botrychium multifidum |
| Венерин башмачок крупноцветковый – Cypripedium macranthon |
| Венерин башмачок настоящий – Cypripedium calceolus |
| Ятрышник шлемоносный – Orchis militaris |
| Гроздовник ланцетовидный – Botrychium lanceolatum |
| Кубышка малая – Nuphar pumila |
| Кувшинка четырехугольная – Nymphaea tetragona |
| Болотноцветник щитолистный – Nymphoides peltata |
| Хаммарбия болотная – Hammarbya paludosa |
| Неккера перистая – Neckera pennata |
Грибы:
| Рогатик пестиковый – Clavariadelphus pistillaris |
| Саркосома шаровидная – Sarcosoma globosum шаровидная |